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常見的真核和原核表達(dá)系統(tǒng)的啟動子(promoters)

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常見的真核和原核表達(dá)系統(tǒng)的啟動子(promoters

真核啟動子

啟動子

主要用途

RNA轉(zhuǎn)錄本

描述

表達(dá)

備注

CMV

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

人類巨細(xì)胞病毒來源的強(qiáng)哺乳動物表達(dá)啟動子

組成型

可能包含一個增強(qiáng)子,在某些細(xì)胞中會沉默

EF1a

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

人延長因子來源的強(qiáng)哺乳動物表達(dá)啟動子

組成型

表達(dá)水平十分穩(wěn)定,與細(xì)胞類型無關(guān)

SV40

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

猿猴空泡病毒40來源的哺乳動物表達(dá)啟動子

組成型

可能包含一個增強(qiáng)子

PGK1 (/小鼠)

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

磷酸甘油酸酯激酶基因來源的哺乳動物啟動子

組成型

廣泛表達(dá),但可能因細(xì)胞類型而異。由于甲基化或脫乙酰作用,傾向于抵抗啟動子下調(diào)。

Ubc

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

人類泛素C基因來源的哺乳動物啟動子

組成型

顧名思義,該啟動子無處不在

human beta actin

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

β-肌動蛋白基因來源的哺乳動物啟動子

組成型

無處不在,雞的啟動子常用與啟動子雜交

CAG

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

強(qiáng)雜交哺乳動物啟動子

組成型

包含CMV的增強(qiáng)子,雞的beta actin啟動子和兔的beta-globin剪接受體

TRE

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

四環(huán)素響應(yīng)元件啟動子

被四環(huán)素或者類似物誘導(dǎo)

通常有本底表達(dá)

UAS

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

Gal4結(jié)合位點的果蠅啟動子

特異的

需要Gal4基因來激活啟動子

Ac5

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

果蠅Actin 5c 基因來源的強(qiáng)昆蟲啟動子

組成型

果蠅表達(dá)系統(tǒng)的常用啟動子

Polyhedrin多角體蛋白

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

桿狀病毒來源的強(qiáng)昆蟲啟動子

組成型

昆蟲表達(dá)系統(tǒng)的常用啟動子

CaMKIIa

光遺傳學(xué)基因表達(dá)

mRNA

Ca2+/鈣調(diào)蛋白依賴的蛋白激酶 II 啟動子

特異的

用于中樞神經(jīng)系統(tǒng)/神經(jīng)元表達(dá)。受到鈣和鈣調(diào)蛋白調(diào)節(jié)。

GAL1, 10

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

酵母雙向啟動子

被半乳糖誘導(dǎo),被葡萄糖抑制

可以單獨(dú)使用或一起使用。受GAL4GAL80調(diào)節(jié)。

TEF1

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

酵母轉(zhuǎn)錄延伸因子啟動子

組成型

與哺乳動物的EF1a 啟動子類似

GDS

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

甘油醛-3-磷酸脫氫酶來源的強(qiáng)的酵母表達(dá)啟動子

組成型

很強(qiáng),也叫做TDH3GAPDH

ADH1

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

乙醇脫氫酶I的酵母啟動子

被乙醇抑制

全長版本很強(qiáng),促進(jìn)高表達(dá)。截短啟動子是組成型的,表達(dá)較低。

CaMV35S

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

花椰菜花葉病毒的強(qiáng)植物啟動子

組成型

在雙子葉植物激活,在單子葉植物中稍微弱一些,在一些動物細(xì)胞中有活性。

Ubi

常規(guī)表達(dá)用

mRNA

玉米泛素基因的植物啟動子

組成型

在植物中促進(jìn)高表達(dá)

H1

RNA 表達(dá)

shRNA

來源于人聚合酶III RNA啟動子

組成型

可能比U6啟動子弱一點,在神經(jīng)元細(xì)胞中表現(xiàn)更佳

U6

RNA 表達(dá)

shRNA

來源于人U6小核啟動子

組成型

小鼠U6也使用,但效率略差。


常用的原核表達(dá)系統(tǒng)啟動子

啟動子

主要用途

描述

表達(dá)

備注

T7

體外轉(zhuǎn)錄/常規(guī)表達(dá)

T7噬菌體來源的啟動子

組成型, 需要T7 RNA聚合酶

當(dāng)用于體外轉(zhuǎn)錄的時候,專路方向有可能是正向的也可能是反向的,取決于啟動子相對于目的基因的方向

T7lac

高水平基因表達(dá)

T7噬菌體來源的啟動子加上lac操縱子

幾乎沒有本底表達(dá),需要T7 RNA聚合酶,受到lac操縱子的控制,可以被IPTG誘導(dǎo)。

常用與pET載體,受到lac操縱子的嚴(yán)格調(diào)控

Sp6

體外轉(zhuǎn)錄/常規(guī)表達(dá)

Sp6噬菌體來源的啟動子

組成型, 需要SP6 RNA 聚合酶

當(dāng)用于體外轉(zhuǎn)錄的時候,專路方向有可能是正向的也可能是反向的,取決于啟動子相對于目的基因的方向

araBAD

常規(guī)表達(dá)用

阿拉伯糖代謝操縱子的啟動子

阿拉伯糖誘導(dǎo)

弱,常用與pBAD載體。適合于快速調(diào)控和低的本底表達(dá)

trp

高水平基因表達(dá)

色氨酸操縱子來源的啟動子

可抑制的

當(dāng)細(xì)胞內(nèi)的色氨酸濃度很高的時候會被一致

lac

常規(guī)表達(dá)用

Lac操縱子來源的啟動子

可以被IPTG或者乳糖誘導(dǎo)

在常規(guī)的大腸桿菌中,lacI阻遏蛋白表達(dá)量不高,僅能滿足細(xì)胞自身的lac操縱子,無法應(yīng)付多拷貝的質(zhì)粒的需求,導(dǎo)致非誘導(dǎo)條件下較高地表達(dá),為了讓表達(dá)系統(tǒng)嚴(yán)謹(jǐn)調(diào)控產(chǎn)物表達(dá),能過量表達(dá)lacI阻遏蛋白的lacIq 突變菌株常被選為Lac/Tac/trc表達(dá)系統(tǒng)的表達(dá)菌株。現(xiàn)在的Lac/Tac/trc載體上通常還帶有lacIq 基因,以表達(dá)更多lacI阻遏蛋白實現(xiàn)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)恼T導(dǎo)調(diào)控。

Ptac

常規(guī)表達(dá)用

Lactrp啟動子雜交而成

lac啟動子的調(diào)節(jié)方式類似

轉(zhuǎn)錄水平高,比lacUV5優(yōu)越

pL

高水平基因表達(dá)

Lambda噬菌體來源的啟動子

溫度調(diào)節(jié)

通常和溫度敏感的cI857 抑制子搭配使用



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