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微生物菌種鑒定分析
序號 | 鑒定方法 | 涉及菌種 | 收費 標準 | 鑒定檢測時間 (工作日) | |
1 | DNA序列分析 | 細菌,放線菌,酵母,霉菌,大型絲狀真菌 | 詢價 | 10-15 | |
2 | 功能基因分析 (pheS,gyrB,gyrA,atpD等) | 乳桿菌,雙歧桿菌,腸球菌,芽胞桿菌 | 詢價 | 10-15 | |
3 | 生理生化分析 | 細菌,放線菌,酵母 | 詢價 | 15-20 | |
4 | Biolog微生物自動分析系統 | 細菌,酵母 | 詢價 | 10-15 | |
5 | API數值分析 | 細菌,釀酒酵母 | 詢價 | 10-15 | |
6 | 形態學分析 | 霉菌 | 詢價 | 15-20 | |
7 | 1、2分別與3、4、5組合 | 細菌,放線菌,酵母,霉菌,大型絲狀真菌 | 詢價 | 20-30 | |
8 | 1、2分別與6組合 | 霉菌,大型絲狀真菌 | 詢價 | 20-30 | |
9 | G+C mol%含量測定 | 細菌,放線菌,酵母 | 詢價 | 15 | |
10 | 脂肪酸組分分析 | 細菌,放線菌,酵母 | 詢價 | 15 | |
11 | DNA-DNA雜交同源性分析 | 細菌,放線菌,酵母 | 詢價 | 15 | |
12 | 電子顯微鏡照片 | 細菌,放線菌,酵母,霉菌 | 詢價 | 15 | |
以上純菌種鑒定出示正規的鑒定分析報告。
rDNA序列分析和功能基因序列報告內容包括:基因組DNA提取方法,DNA電泳圖,PCR反應條件,PCR反應程序,PCR電泳圖,DNA序列,系統發育樹和系統發育分析結果。
生理生化數值分析報告內容包括:菌落和菌體形態特征描述,理化特征指標,菌落照片和菌體照片,鑒定分析結果。
Biolog全自動分析和API數值分析報告內容包括:反應數值圖譜,菌落照片和菌體照片,鑒定分析結果。
形態學分析報告內容包括:形態學培養條件,培養特征描述,顯微特征描述,培養特征圖片,顯微形態圖片,鑒定分析結果。
G+C mol%含量測定報告包括:基因組DNA提取方法,DNA電泳圖,測定方法,測定曲線圖,G+C mol%含量測定數值。
脂肪酸組分分析報告內容包括:脂肪酸提取方法,脂肪酸測定數值,分析結果。
DNA-DNA雜交同源性分析報告內容包括:基因組DNA提取方法,DNA電泳圖,測定方法,測定曲線圖,測定數值,DNA-DNA雜交同源性結果。
電子顯微鏡照片內容包括:5000倍,10000倍15000倍和20000倍的
(1)常規鑒定
常規鑒定內容有形態特征和理化特性。形態特征包括顯微形態和培養特征;理化特性包括營養類型、碳氮源利用能力、各種代謝反應、酶反應和血清學反應等。
(2)BIOLOG碳源自動分析鑒定
BIOLOG鑒定系統以微生物對不同碳源的利用情況為基礎,檢測微生物的特征指紋圖譜,建立與微生物種類相對應的數據庫。通過軟件將待測微生物與數據庫參比,得出鑒定結果。
該系統已獲美國FDA認可,已逐步應用于食品和飲品企業、環保、海洋生物/水產品、制藥、農業微生物、生物治理、化妝品、臨床等領域的微生物鑒定試驗中。
寶杰羅公司擁有國內最全的BIOLOG數據庫,涉及革蘭氏陰性菌、革蘭氏陽性菌、厭氧菌、酵母、絲狀真菌在內近2500種微生物。
(3)分子生物學鑒定
應用分子生物學方法從遺傳進化角度闡明微生物種群之間的分類學關系,是目前微生物分類學研究普遍采用的鑒定方法。公司擁有微生物菌種分類鑒定的分子生物學實驗室,配有PCR儀、高速冷凍離心機、電泳儀、HPLC、凝膠成像系統、紫外控溫分析系統等先進儀器設備,以及DNAMAN、BIOEDIT、CLUSTALX、TREEVIEW等序列分析軟件。目前公司可采用核酸序列分析法分析細菌16S rDNA/16S-23S rDNA區間、功能基因序列、酵母26S rDNA(D1/D2)序列及絲狀真菌的 ITS1-5.8S-ITS2序列,提供科學的鑒定結果。
(4)API細菌數值鑒定系統
API鑒定系統涵蓋15個鑒定系列,約有1000種生化反應,目前已可鑒定超過600種的細菌。鑒定過程中,可根據細菌所屬類群選擇適當的生理生化鑒定系列,通過軟件將待測細菌與數據庫參比,得出鑒定結果。
公司目前可應用API 50CH系列、API 20 E系列、API Staph系列對乳酸桿菌(Lactobacillus sp.)和相關細菌、芽孢桿菌(Bacillus sp.)、葡萄球菌屬(Staphylococcus sp.)、微球菌屬(Micrococcus sp.)和庫克菌屬(Locuria sp.)進行鑒定。
(5)功能性分析及功能基因
公司不斷致力于工業微生物資源的功能及其功能基因研究,目前通過木聚糖酶、纖維素酶、葡萄糖異構酶、β-甘露聚糖酶等功能基因的克隆進行菌種產酶的功能性分析。應用gyrA、atpD及pheS等看家基因于微生物菌種鑒定,在某些種、亞種、株間有較好的分辨效果。
(6)RAPD、SSCP技術
隨著微生物菌種應用的進一步發展,在食品安全管理、生物產品出口認證、知識產權保護等行業需求日益增加,微生物菌種株水平的鑒別技術成為一個迫切需要解決的問題。
采用隨機擴增多態性DNA(Randomly amplified polymorphism DNA,RAPD)技術和單鏈構象多態性(Single Strand Conformation Polymorphism,SSCP)技術對微生物菌株進行鑒別。如采用RAPD技術能夠對同一菌種原始菌株與誘變菌株進行鑒別,對誘變菌株知識產權保護具有重要意義;采用SSCP技術進行工業酒精酵母菌株的鑒別,此技術結合菌株發酵特性,在酒類生產的質量控制方面起到積極作用。
(7)TLC薄層層析
寶杰羅公司將TLC薄層層析技術應用于微生物菌種鑒定,進行細菌、放線菌細胞壁化學組分分析(氨基酸、糖),作為劃分屬特征的重要鑒定技術手段,起到了良好的輔助作用。
(8)全細胞脂肪酸分析鑒定系統
采用Sherlock全自動細菌鑒定系統,通過對不同菌株的脂肪酸圖譜進行分析,并與標準數據庫進行比對,來鑒定細菌及酵母。該技術是細菌或酵母種水平鑒定的有效手段之一。
(9)(G+C)mol%及DNA/DNA雜交
公司通過采用DU800核酸蛋白分析儀測定Tm值,從而得到微生物菌株的(G+C)mol%,并與模式菌株進行DNA-DNA同源性雜交分析,該鑒定技術手段是多相鑒定的重要組成部分。
(10)其他手段
極性脂肪酸檢測,呼吸醌檢測,電子顯微鏡
北京大學環境科學與工程學院
清華大學化學工程系
北京理工大學生物系
北京工業大學生物系
北京林業大學林學院
首都師范大學生物系
北京化工大學生物工程系
農業大學食品學院
浙江大學農學院
南昌大學食品學院
江西農業大學食品學院
大連海洋大學
廣西大學
廣西理工大學
貴陽學院
華僑大學
西北農林科技大學
南京林業大學
天津科技大學
天津大學
河北農業大學
河北大學
海洋大學
合肥工業大學
河南農業大學
沈陽農業大學
東北大學
吉林大學
吉林農大
哈爾濱理工大學
東北農業大學
中科院水生生物所
中科院生態環境研究中心
中科院南海海域研究所
中科院西藏研究所
中科院成都生物研究所
農科院畜牧研究所
農科院蜜蜂研究所
農科院農產品加工研究所
農科院蔬菜研究所
農科院作物科學研究所
農業部天津環保檢測所
浙江省農業科學院
山西省農業科學院
廣西省科學院
山東省農科院
黑龍江省農科院
北京市農林科學院蔬菜研究中心
華北制藥公司
哈爾濱制藥三廠
蘇州光景生物科技有限公司
北京四環制藥公司
北京明德天成科技有限公司
等等。
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